Tarihi yapısı ve mimarisiyle göz dolduran ancak, yaklaşık bir yıldır restorasyon çalışmaları süren, Anadolu Selçuklu mimarisi olan Çifte Minareli Medrese, şoka uğrattı.  Resterasyon çalışmaları sonucunda medrese odalarına monte edilen klimalara yerli ve yabancı turistler bir anlam veremedi.

Çalışmaları kısmen sonlanan ancak peyzaj çalışmaları devam eden Çifte Minareli Medrese'nin, içerisinde bulunan tarihi odaların sıvanarak beyaza boyanması da tepki çekti.