Libya’daki en büyük Arap kabilelerinden sayılan Menife’ye mensup olan Ömer Muhtar, 1862’de Berka’nın Defne bölgesindeki Butnân’da doğdu. Bölgede etkin olan Senusi Hareketi medreselerinde okudu ve başarılı bir öğrenci olmasından dolayı Mehdî es-Senûsî’nin dikkatini çekti. Ömer Muhtar 1895’te onunla birlikte Tâc köyüne gitti.